Biblioteca Ecclesia este organizată astfel încât să se faciliteze desfășurarea optimă a proceselor specifice Bibliotecilor universitare, asigurând suportul info-documentar al tuturor disciplinelor predate în învățământul superior cu specific teologic, în conformitate cu planul de învățământ al Facultății și al domeniilor de cercetare științifică ale Școlii Doctorale Dumitru Stăniloaie.
Accesul la colecțiile Bibliotecii Ecclesia este asigurat doar utilizatorilor înscriși și se realizează exclusiv în baza Permisului de acces, eliberat și vizat de către personalul responsabil al Bibliotecii. Accesul la colecții poate fi limitat, în baza Regulamentului Bibliotecii, în funcție de constituirea sau disponibilitatea acestora.